1. 整肠作用，调整微生态失调，防治腹泻便秘；益生菌冻干粉活着进入人体肠道内，对病毒和细菌性急性肠炎及痢疾，便秘等都有治疗及预防作用。益生菌本身和很多慢性胃炎，消化道溃疡等消化道疾病有密切的关系。益生菌冻干粉能抗胃酸，粘附在胃壁上皮细胞表面，通过其代谢活动抑制幽门螺旋杆菌的生长，预防胃溃疡的发生。

2.促进机体营养吸收；益生菌冻干粉能分解乳糖成为乳酸，减轻乳糖不耐症。

3. 预防阴道感染；不少益生菌有酸化泌尿生殖道的作用。益生菌冻干粉可以通过降低pH值来抑制有害细菌的生长。还可以通过与有害细菌竞争空间和资源而遏制它们。

4. 益生菌冻干粉有助于增强人体免疫力。益生菌可产生有机酸、游离脂肪酸、过氧化氢、细菌素抑制其它有害菌的生长；通过“生物夺氧”使需氧型致病菌大幅度下降，益生菌能够定殖于粘膜、皮肤等表面或细胞之间形成生物屏障，这些屏障可以阻止病原微生物的定殖，起着占位、争夺营养、互利共生或拮抗作用。并可以刺激机体的非特异性免疫功能，提高自然杀伤(NK)细胞的活性，增强肠道免疫球蛋白IgA的分泌，改善肠道的屏障功能。

5. 缓解过敏作用；过敏是一种免疫疾病，是人体内免疫功能失调出现不平衡的状况。益生菌疗法是目前国内外流行辅助治疗过敏的有效方法之一。能利用益生菌调节体内免疫球蛋白（IgE）抗体，达到缓解过敏的免疫疗法。

6. 降低血清胆固醇；可能与其调节和利用内源性代谢产物并且加速短链脂肪酸代谢有关。

7. 预防癌症和抑制肿瘤生长等。益生菌冻干粉可抑制肠道内某些酶的活性，如β—葡糖醋酸酶、β—葡糖醛酸酶、尿素、酶、硝基还原酶、偶氮还原酶等。这些酶可能参与肠道内致癌物的形成。胆盐经肠道碰到有害菌可能发生解离，就会产生致癌物质，容易引起肠癌。但益生菌冻干粉可以抑制有害菌，即使有胆盐的存在，致癌率也大大降低。

对于益生菌这种干燥热敏性制品和需要保持生物活性的物质，冷冻干燥技术对生物组织和细胞结构和特征的损伤较小，使其快速进入休眠状态，有效保护了益生菌这类许多热敏性制品有效成份的稳定性。